Showing chemical card for 5,6-dihydrothymine (CFc000283726)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-09-14 03:37:16 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemfont ID | CFc000283726 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | 5,6-dihydrothymine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Definition | Dihydrothymine, also known as 5,6-dihydro-5-methyluracil or 5,6-dihydrothymine, (S)-isomer, is a member of the class of compounds known as hydropyrimidines. Hydropyrimidines are compounds containing a hydrogenated pyrimidine ring (i.e. containing less than the maximum number of double bonds.). Dihydrothymine is soluble (in water) and a very weakly acidic compound (based on its pKa). Dihydrothymine can be found in a number of food items such as hyssop, arrowroot, nopal, and red rice, which makes dihydrothymine a potential biomarker for the consumption of these food products. Dihydrothymine can be found primarily in blood, cerebrospinal fluid (CSF), saliva, and urine, as well as in human prostate tissue. Dihydrothymine exists in all living organisms, ranging from bacteria to humans. In humans, dihydrothymine is involved in the pyrimidine metabolism. Dihydrothymine is also involved in few metabolic disorders, which include beta ureidopropionase deficiency, dihydropyrimidinase deficiency, MNGIE (mitochondrial neurogastrointestinal encephalopathy), and UMP synthase deficiency (orotic aciduria). Moreover, dihydrothymine is found to be associated with beta-ureidopropionase deficiency and dihydropyrimidinase deficiency. Dihydrothymine is a non-carcinogenic (not listed by IARC) potentially toxic compound. Dihydrothymine is an intermediate in the metabolism of thymine . Dihydropyrimidine dehydrogenase catalyzes the reduction of thymine to 5, 6-dihydrothymine then dihydropyrimidinase hydrolyzes 5, 6-dihydrothymine to N-carbamyl-b-alanine. Finally, beta-ureidopropionase catalyzes the conversion of N-carbamyl-b-alanine to beta-alanine. Accumulation of dihydrothymine in the body has been shown to be toxic (T3DB). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C5H8N2O2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 128.1292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 128.05857751 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | 5-methyl-1,3-diazinane-2,4-dione | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | dihydrothymine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | 696-04-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CC1CNC(=O)NC1=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C5H8N2O2/c1-3-2-6-5(9)7-4(3)8/h3H,2H2,1H3,(H2,6,7,8,9) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | NBAKTGXDIBVZOO-UHFFFAOYSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as hydropyrimidines. Hydropyrimidines are compounds containing a hydrogenated pyrimidine ring (i.E. Containing less than the maximum number of double bonds.). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organoheterocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Diazines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Pyrimidines and pyrimidine derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Hydropyrimidines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | Biological location
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Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | Biological role
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0304210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | FDB030555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | C00052265 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 84456 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C00906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 27468 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available |