Showing chemical card for PS(20:5(7Z,9Z,11E,13E,17Z)-3OH(5,6,15)/22:5(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z)) (CFc000262879)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-09-14 02:58:20 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemfont ID | CFc000262879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | PS(20:5(7Z,9Z,11E,13E,17Z)-3OH(5,6,15)/22:5(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Definition | PS(20:5(7Z,9Z,11E,13E,17Z)-3OH(5,6,15)/22:5(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z)) is an oxidized phosphatidylserine (PS). Oxidized phosphatidylserines are glycerophospholipids in which a phosphorylserine moiety occupies a glycerol substitution site and at least one of the fatty acyl chains has undergone oxidation. As all oxidized lipids, oxidized phosphatidylserines belong to a group of biomolecules that have a role as signaling molecules. The biosynthesis of oxidized lipids is mediated by several enzymatic families, including cyclooxygenases (COX), lipoxygenases (LOX) and cytochrome P450s (CYP). Non-enzymatically oxidized lipids are produced by uncontrolled oxidation through free radicals and are considered harmful to human health (PMID: 33329396 ). As is the case with diacylglycerols, phosphatidylserines can have many different combinations of fatty acids of varying lengths, saturation and degrees of oxidation attached at the C-1 and C-2 positions. PS(20:5(7Z,9Z,11E,13E,17Z)-3OH(5,6,15)/22:5(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z)), in particular, consists of one chain of one Lipoxin A5 at the C-1 position and one chain of 4Z,7Z,10Z,13Z,16Z-docosapentaenoyl at the C-2 position. Phospholipids are ubiquitous in nature and are key components of the lipid bilayer of cells, as well as being involved in metabolism and signaling. Similarly to what occurs with phospholipids, the fatty acid distribution at the C-1 and C-2 positions of glycerol within oxidized phospholipids is continually in flux, owing to phospholipid degradation and the continuous phospholipid remodeling that occurs while these molecules are in membranes. Oxidized PSs can be synthesized via three different routes. In one route, the oxidized PS is synthetized de novo following the same mechanisms as for PSs but incorporating oxidized acyl chains (PMID: 33329396 ). An alternative is the transacylation of one of the non-oxidized acyl chains with an oxidized acylCoA (PMID: 33329396 ). The third pathway results from the oxidation of the acyl chain while still attached to the PS backbone, mainly through the action of LOX (PMID: 33329396 ). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C48H74NO13P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 904.088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 903.489778445 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2S)-2-amino-3-({[(2R)-2-[(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z)-docosa-4,7,10,13,16-pentaenoyloxy]-3-{[(5S,6S,7Z,9Z,11E,13E,15R,17Z)-5,6,15-trihydroxyicosa-7,9,11,13,17-pentaenoyl]oxy}propoxy](hydroxy)phosphoryl}oxy)propanoic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | (2S)-2-amino-3-{[(2R)-2-[(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z)-docosa-4,7,10,13,16-pentaenoyloxy]-3-{[(5S,6S,7Z,9Z,11E,13E,15R,17Z)-5,6,15-trihydroxyicosa-7,9,11,13,17-pentaenoyl]oxy}propoxy(hydroxy)phosphoryl]oxy}propanoic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [H][C@@](COC(=O)CCC[C@H](O)[C@@H](O)\C=C/C=C\C=C\C=C\[C@H](O)C\C=C/CC)(COP(O)(=O)OC[C@H](N)C(O)=O)OC(=O)CC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C48H74NO13P/c1-3-5-7-8-9-10-11-12-13-14-15-16-17-18-19-20-21-26-30-36-47(54)62-42(39-60-63(57,58)61-40-43(49)48(55)56)38-59-46(53)37-31-35-45(52)44(51)34-29-25-23-22-24-28-33-41(50)32-27-6-4-2/h6,9-10,12-13,15-16,18-19,21-29,33-34,41-45,50-52H,3-5,7-8,11,14,17,20,30-32,35-40,49H2,1-2H3,(H,55,56)(H,57,58)/b10-9-,13-12-,16-15-,19-18-,24-22+,25-23-,26-21-,27-6-,33-28+,34-29-/t41-,42-,43+,44+,45+/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | CTDKZONOJXPZQH-XDHUKQMJSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as phosphatidylserines. These are glycerophosphoserines in which two fatty acids are bonded to the glycerol moiety through ester linkages. As is the case with diacylglycerols, phosphatidylserines can have many different combinations of fatty acids of varying lengths and saturation attached to the C-1 and C-2 positions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Glycerophospholipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Glycerophosphoserines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Phosphatidylserines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | Biological location
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Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0283363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 156986715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available |