Showing chemical card for PGP(20:3(8Z,11Z,14Z)/20:3(5Z,8Z,11Z)) (CFc000096866)
| Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-09-13 21:09:50 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemfont ID | CFc000096866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecule Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | PGP(20:3(8Z,11Z,14Z)/20:3(5Z,8Z,11Z)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Definition | PGP(20:3(8Z,11Z,14Z)/20:3(5Z,8Z,11Z)) is a phosphatidylglycerophosphate (PGP). It is a glycerophospholipid in which a phosphoglycerol moiety occupies a glycerol substitution site followed by another phosphate moiety. Phosphatidylglycerolphosphate is present at a level of 1-2% in most animal tissues, but it can be the second most abundant phospholipid in lung surfactant (up to 11% of the total). It is well established that the concentration of phosphatidylglycerolphosphate increases during fetal development. Phosphatidylglycerolphosphate may be present in animal tissues merely as a precursor for cardiolipin synthesis. As is the case with diacylglycerols, phosphatidylglycerophosphates can have many different combinations of fatty acids of varying lengths and saturation attached to the C-1 and C-2 positions. Fatty acids containing 16, 18 and 20 carbons are the most common. PGP(20:3(8Z,11Z,14Z)/20:3(5Z,8Z,11Z)), in particular, consists of one chain of dihomo-gamma-linolenic acid at the C-1 position and one chain of mead acid at the C-2 position. They are synthesized by the addition of glycerol 3-phosphate to a CDP-diacylglycerol. In turn, PGPs are dephosphorylated to phosphatidylglycerols (PGs). While most phospholipids have a saturated fatty acid on C-1 and an unsaturated fatty acid on C-2 of the glycerol backbone, the fatty acid distribution at the C-1 and C-2 positions of glycerol within phospholipids is continually in flux, owing to phospholipid degradation and the continuous phospholipid remodeling that occurs while these molecules are in membranes. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Formula | C46H80O13P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 903.081 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 902.507416632 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | [(2S)-2-hydroxy-3-({hydroxy[(2R)-2-[(5Z,8Z,11Z)-icosa-5,8,11-trienoyloxy]-3-[(8Z,11Z,14Z)-icosa-8,11,14-trienoyloxy]propoxy]phosphoryl}oxy)propoxy]phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | (2S)-2-hydroxy-3-{[hydroxy((2R)-2-[(5Z,8Z,11Z)-icosa-5,8,11-trienoyloxy]-3-[(8Z,11Z,14Z)-icosa-8,11,14-trienoyloxy]propoxy)phosphoryl]oxy}propoxyphosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | [H][C@](O)(COP(O)(O)=O)COP(O)(=O)OC[C@@]([H])(COC(=O)CCCCCC\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCCCCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C46H80O13P2/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-19-21-23-25-27-29-31-33-35-37-45(48)55-41-44(42-58-61(53,54)57-40-43(47)39-56-60(50,51)52)59-46(49)38-36-34-32-30-28-26-24-22-20-18-16-14-12-10-8-6-4-2/h11,13,17-20,23-26,30,32,43-44,47H,3-10,12,14-16,21-22,27-29,31,33-42H2,1-2H3,(H,53,54)(H2,50,51,52)/b13-11-,19-17-,20-18-,25-23-,26-24-,32-30-/t43-,44+/m0/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | YLCXXOXCVCSPAP-UQBKPOFQSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as phosphatidylglycerophosphates. These are glycerophosphoglycerophosphates in which two fatty acids are bonded to the 1-glycerol moiety through ester linkages. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Glycerophospholipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Glycerophosphoglycerophosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Phosphatidylglycerophosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physiological effect | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disposition | Source
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Role | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0116457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 74878169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 131823112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||