Showing chemical card for CDP-DG(18:2(9Z,11Z)/i-19:0) (CFc000096468)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-09-13 21:09:15 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemfont ID | CFc000096468 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | CDP-DG(18:2(9Z,11Z)/i-19:0) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Definition | CDP-DG(18:2(9Z,11Z)/i-19:0) is a cytidine diphosphate diacylglycerol or CDP-diacylglycerol (CDP-DG). CDP-diacylglycerol is an important branchpoint intermediate in eukaryotic phospholipid biosynthesis and could be a key regulatory molecule in phospholipid metabolism. It is a glycerophospholipid in which a cytidine diphosphate moiety occupies a glycerol substitution site. As is the case with diacylglycerols, CDP-diacylglycerols can have many different combinations of fatty acids of varying lengths and saturation attached at the C-1 and C-2 positions. Fatty acids containing 16, 18 and 20 carbons are the most common. CDP-DG(18:2(9Z,11Z)/i-19:0), in particular, consists of one chain of (9Z,11Z)-octadecadienoic acid at the C-1 position and one chain of isononadecanoic acid at the C-2 position. Cytidine diphosphate diacylglycerols are rarely noticed in analyses of lipid compositions of tissues, as they are present is such small amounts (perhaps only 0.05% or so of the total phospholipids). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C49H87N3O15P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 1020.189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 1019.561243109 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | {[(2R,3R,5R)-5-(4-amino-2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy}({hydroxy[(2R)-2-[(17-methyloctadecanoyl)oxy]-3-[(9Z,11Z)-octadeca-9,11-dienoyloxy]propoxy]phosphoryl}oxy)phosphinic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | [(2R,3R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy([hydroxy((2R)-2-[(17-methyloctadecanoyl)oxy]-3-[(9Z,11Z)-octadeca-9,11-dienoyloxy]propoxy)phosphoryl]oxy)phosphinic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [H][C@@](COC(=O)CCCCCCC\C=C/C=C\CCCCCC)(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H](C(O)[C@H]1O)N1C=CC(N)=NC1=O)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCC(C)C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C49H87N3O15P2/c1-4-5-6-7-8-9-10-11-12-15-18-21-24-27-30-33-44(53)62-37-41(65-45(54)34-31-28-25-22-19-16-13-14-17-20-23-26-29-32-40(2)3)38-63-68(58,59)67-69(60,61)64-39-42-46(55)47(56)48(66-42)52-36-35-43(50)51-49(52)57/h9-12,35-36,40-42,46-48,55-56H,4-8,13-34,37-39H2,1-3H3,(H,58,59)(H,60,61)(H2,50,51,57)/b10-9-,12-11-/t41-,42-,46+,47?,48-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | CSSVOKRJQPIPSZ-PXKAAIOPSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as cdp-diacylglycerols. These are glycerolipids containing a diacylglycerol, with a cytidine diphosphate attached to the oxygen O1 or O2 of the glycerol part. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Glycerophospholipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | CDP-glycerols | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | CDP-diacylglycerols | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | Source
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Process | Naturally occurring process
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Role | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0116059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 74877796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 131822715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available |