Showing chemical card for CDP-DG(20:4(5Z,8Z,11Z,14Z)/20:3(5Z,8Z,11Z)) (CFc000096404)
| Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-09-13 21:09:10 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemfont ID | CFc000096404 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecule Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | CDP-DG(20:4(5Z,8Z,11Z,14Z)/20:3(5Z,8Z,11Z)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Definition | CDP-DG(20:4(5Z,8Z,11Z,14Z)/20:3(5Z,8Z,11Z)) is a cytidine diphosphate diacylglycerol or CDP-diacylglycerol (CDP-DG). CDP-diacylglycerol is an important branchpoint intermediate in eukaryotic phospholipid biosynthesis and could be a key regulatory molecule in phospholipid metabolism. It is a glycerophospholipid in which a cytidine diphosphate moiety occupies a glycerol substitution site. As is the case with diacylglycerols, CDP-diacylglycerols can have many different combinations of fatty acids of varying lengths and saturation attached at the C-1 and C-2 positions. Fatty acids containing 16, 18 and 20 carbons are the most common. CDP-DG(20:4(5Z,8Z,11Z,14Z)/20:3(5Z,8Z,11Z)), in particular, consists of one chain of arachidonic acid at the C-1 position and one chain of mead acid at the C-2 position. Cytidine diphosphate diacylglycerols are rarely noticed in analyses of lipid compositions of tissues, as they are present is such small amounts (perhaps only 0.05% or so of the total phospholipids). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Chemical Formula | C52H83N3O15P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 1052.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 1051.529942981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | {[(2R,3R,5R)-5-(4-amino-2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy}({hydroxy[(2R)-3-[(5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoyloxy]-2-[(5Z,8Z,11Z)-icosa-5,8,11-trienoyloxy]propoxy]phosphoryl}oxy)phosphinic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | [(2R,3R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy([hydroxy((2R)-3-[(5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoyloxy]-2-[(5Z,8Z,11Z)-icosa-5,8,11-trienoyloxy]propoxy)phosphoryl]oxy)phosphinic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | [H][C@@](COC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC)(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H](C(O)[C@H]1O)N1C=CC(N)=NC1=O)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCCCCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C52H83N3O15P2/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-19-21-23-25-27-29-31-33-35-37-47(56)65-41-44(68-48(57)38-36-34-32-30-28-26-24-22-20-18-16-14-12-10-8-6-4-2)42-66-71(61,62)70-72(63,64)67-43-45-49(58)50(59)51(69-45)55-40-39-46(53)54-52(55)60/h11,13,17-20,23-26,29-32,39-40,44-45,49-51,58-59H,3-10,12,14-16,21-22,27-28,33-38,41-43H2,1-2H3,(H,61,62)(H,63,64)(H2,53,54,60)/b13-11-,19-17-,20-18-,25-23-,26-24-,31-29-,32-30-/t44-,45-,49+,50?,51-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | YMDVVYOPKWDGNZ-SXRRNCCSSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as cdp-diacylglycerols. These are glycerolipids containing a diacylglycerol, with a cytidine diphosphate attached to the oxygen O1 or O2 of the glycerol part. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Glycerophospholipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | CDP-glycerols | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | CDP-diacylglycerols | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents |
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| Substituents |
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| Molecular Framework | Aromatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physiological effect | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disposition | Source
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| Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Role | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
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| External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0115995 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 74877733 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 131822651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||