Showing chemical card for CDP-DG(20:3(8Z,11Z,14Z)/18:2(9Z,12Z)) (CFc000096393)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-09-13 21:09:09 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemfont ID | CFc000096393 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | CDP-DG(20:3(8Z,11Z,14Z)/18:2(9Z,12Z)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Definition | CDP-DG(20:3(8Z,11Z,14Z)/18:2(9Z,12Z)) is a cytidine diphosphate diacylglycerol or CDP-diacylglycerol (CDP-DG). CDP-diacylglycerol is an important branchpoint intermediate in eukaryotic phospholipid biosynthesis and could be a key regulatory molecule in phospholipid metabolism. It is a glycerophospholipid in which a cytidine diphosphate moiety occupies a glycerol substitution site. As is the case with diacylglycerols, CDP-diacylglycerols can have many different combinations of fatty acids of varying lengths and saturation attached at the C-1 and C-2 positions. Fatty acids containing 16, 18 and 20 carbons are the most common. CDP-DG(20:3(8Z,11Z,14Z)/18:2(9Z,12Z)), in particular, consists of one chain of dihomo-gamma-linolenic acid at the C-1 position and one chain of linoleic acid at the C-2 position. Cytidine diphosphate diacylglycerols are rarely noticed in analyses of lipid compositions of tissues, as they are present is such small amounts (perhaps only 0.05% or so of the total phospholipids). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C50H83N3O15P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 1028.168 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 1027.529942981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | {[(2R,3R,5R)-5-(4-amino-2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy}({hydroxy[(2R)-3-[(8Z,11Z,14Z)-icosa-8,11,14-trienoyloxy]-2-[(9Z,12Z)-octadeca-9,12-dienoyloxy]propoxy]phosphoryl}oxy)phosphinic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | [(2R,3R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy([hydroxy((2R)-3-[(8Z,11Z,14Z)-icosa-8,11,14-trienoyloxy]-2-[(9Z,12Z)-octadeca-9,12-dienoyloxy]propoxy)phosphoryl]oxy)phosphinic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [H][C@@](COC(=O)CCCCCC\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC)(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H](C(O)[C@H]1O)N1C=CC(N)=NC1=O)OC(=O)CCCCCCC\C=C/C\C=C/CCCCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C50H83N3O15P2/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-19-20-22-23-25-27-29-31-33-35-45(54)63-39-42(66-46(55)36-34-32-30-28-26-24-21-18-16-14-12-10-8-6-4-2)40-64-69(59,60)68-70(61,62)65-41-43-47(56)48(57)49(67-43)53-38-37-44(51)52-50(53)58/h11-14,17-19,21-23,37-38,42-43,47-49,56-57H,3-10,15-16,20,24-36,39-41H2,1-2H3,(H,59,60)(H,61,62)(H2,51,52,58)/b13-11-,14-12-,19-17-,21-18-,23-22-/t42-,43-,47+,48?,49-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | YWLWLOBBRMOKCL-HMTNQKGYSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as cdp-diacylglycerols. These are glycerolipids containing a diacylglycerol, with a cytidine diphosphate attached to the oxygen O1 or O2 of the glycerol part. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Glycerophospholipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | CDP-glycerols | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | CDP-diacylglycerols | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | Source
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Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0115984 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 74877722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 131822640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available |