Showing chemical card for Ganglioside GD1b (d18:1/16:0) (CFc000007388)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-09-13 18:53:40 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemfont ID | CFc000007388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Ganglioside GD1b (d18:1/16:0) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Definition | 3291 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Formula | C83H145N3O39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 1809.0361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 1807.945521913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2S,4S,5R)-6-[(1S,2R)-2-{[(2S,4S,5R)-2-carboxy-5-acetamido-4-hydroxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]oxan-2-yl]oxy}-1,3-dihydroxypropyl]-5-acetamido-2-{[(2S,3R,4R,5S,6R)-2-{[(2R,3S,4R,5R,6R)-6-{[(2S,3R)-2-hexadecanamido-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl]oxy}-4,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxy}-3-hydroxy-5-{[(2S,3R,4R,5R,6R)-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-(2-oxopropyl)-4-{[(2R,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}oxan-2-yl]oxy}-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy}-4-hydroxyoxane-2-carboxylic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | (2S,4S,5R)-6-[(1S,2R)-2-{[(2S,4S,5R)-2-carboxy-5-acetamido-4-hydroxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]oxan-2-yl]oxy}-1,3-dihydroxypropyl]-5-acetamido-2-{[(2S,3R,4R,5S,6R)-2-{[(2R,3S,4R,5R,6R)-6-{[(2S,3R)-2-hexadecanamido-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl]oxy}-4,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxy}-3-hydroxy-5-{[(2S,3R,4R,5R,6R)-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-(2-oxopropyl)-4-{[(2R,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}oxan-2-yl]oxy}-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy}-4-hydroxyoxane-2-carboxylic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [H][C@@](O)(CO)[C@@]([H])(O)C1O[C@@](C[C@]([H])(O)[C@@]1([H])NC(C)=O)(O[C@]([H])(CO)[C@@]([H])(O)C1O[C@@](C[C@]([H])(O)[C@@]1([H])NC(C)=O)(O[C@]1([H])[C@@]([H])(O)[C@]([H])(O[C@]2([H])[C@@]([H])(CO)O[C@@]([H])(OC[C@]([H])(NC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC)[C@]([H])(O)C=CCCCCCCCCCCCCC)[C@]([H])(O)[C@@]2([H])O)O[C@]([H])(CO)[C@]1([H])O[C@]1([H])O[C@]([H])(CO)[C@]([H])(O)[C@]([H])(O[C@]2([H])O[C@]([H])(CO)[C@]([H])(O)[C@]([H])(O)[C@@]2([H])O)[C@@]1([H])CC(C)=O)C(O)=O)C(O)=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C83H145N3O39/c1-6-8-10-12-14-16-18-20-22-24-26-28-30-32-49(96)48(86-58(100)33-31-29-27-25-23-21-19-17-15-13-11-9-7-2)43-114-77-68(108)66(106)71(56(41-91)117-77)120-79-69(109)75(72(57(42-92)118-79)121-76-47(34-44(3)93)70(63(103)54(39-89)115-76)119-78-67(107)65(105)62(102)53(38-88)116-78)125-83(81(112)113)36-51(98)60(85-46(5)95)74(124-83)64(104)55(40-90)122-82(80(110)111)35-50(97)59(84-45(4)94)73(123-82)61(101)52(99)37-87/h30,32,47-57,59-79,87-92,96-99,101-109H,6-29,31,33-43H2,1-5H3,(H,84,94)(H,85,95)(H,86,100)(H,110,111)(H,112,113)/t47-,48+,49-,50+,51+,52-,53-,54-,55-,56-,57-,59-,60-,61-,62+,63+,64-,65+,66-,67-,68-,69-,70-,71-,72+,73?,74?,75-,76+,77-,78+,79+,82-,83+/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | GRGARPRHAYNQDP-BWABZUPISA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as gangliosides. These are lipid molecules composed of a glycosphingolipid (ceramide and saccharide) with one or more sialic acids linked on the sugar chain. They are usually oligoglycosylceramides derived from lactosylceramide and containing a sialic acid residue such as N-acetylneuraminic acid. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Sphingolipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Glycosphingolipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Gangliosides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | Organoleptic effect
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Disposition | Biological location
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Process | Naturally occurring process
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Role | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0011824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | FDB028493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available |