Showing chemical card for Galabiosylceramide (d18:1/9Z-18:1) (CFc000002205)
| Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-09-13 18:47:02 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemfont ID | CFc000002205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecule Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Galabiosylceramide (d18:1/9Z-18:1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Definition | Galabiosylceramide is a non-acidic diglycosphingolipids, i.e. a sphingolipid with two or more carbohydrate moieties attached to a ceramide unit. It is a vital component of cellular membranes of most eukaryotic organisms and some bacteria. Its abundance relative to other lipids is usually low other than in epithelial and neuronal cells. Galabiosylceramide is one of the lipids that accumulate in excessive amounts in Fabry's disease. Fabry disease (FD) is an X-linked inborn error of glycosphingolipid (GSL) metabolism, caused by a deficiency of the lysosomal alpha-galactosidase A, which results in high levels in lysosomes and biological fluids of galabiosylceramide, also known as digalactosylceramide (Ga2). In Fabry disease, accumulation of galabiosylceramide is observed by coloration methods associated to optic or electron microscopy or more recently, with imaging mass spectrometry. Galabiosylceramide is the precursor of a series of oligoglycosylceramides. In animal tissues, biosynthesis involves addition of a second monosaccharide unit from the appropriate sugar nucleotide to a monoglycosylceramide, catalysed by a glycosyl transferase, in the lumen of the Golgi apparatus. Glycolipids are important components of the body's immune defense system, either in haptenic reactivity or in antibody-producing potency, i.e. as cellular immunogens or antigens. (PMID: 15702404 , 15959771 , 16324673 , 14761135 ). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Formula | C48H89NO13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 888.2192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 887.633391939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | N-(1-{[(2R,3R,4R,5R,6R)-3,4-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-5-{[(2R,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}oxan-2-yl]oxy}-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl)octadec-9-enimidic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | N-(1-{[(2R,3R,4R,5R,6R)-3,4-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-5-{[(2R,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}oxan-2-yl]oxy}-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl)octadec-9-enimidic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | [H]C(O)(C=CCCCCCCCCCCCCC)C([H])(CO[C@]1([H])O[C@]([H])(CO)[C@]([H])(O[C@@]2([H])O[C@]([H])(CO)[C@]([H])(O)[C@]([H])(O)[C@@]2([H])O)[C@]([H])(O)[C@@]1([H])O)N=C(O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C48H89NO13/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-18-20-22-24-26-28-30-32-40(53)49-36(37(52)31-29-27-25-23-21-19-16-14-12-10-8-6-4-2)35-59-47-45(58)43(56)46(39(34-51)61-47)62-48-44(57)42(55)41(54)38(33-50)60-48/h17-18,29,31,36-39,41-48,50-52,54-58H,3-16,19-28,30,32-35H2,1-2H3,(H,49,53)/t36?,37?,38-,39-,41+,42+,43-,44-,45-,46+,47-,48-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | YVBUQOZKCCPFCZ-KRWOEUDHSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as glycosyl-n-acylsphingosines. Glycosyl-N-acylsphingosines are compounds containing a sphingosine linked to a simple glucosyl moiety. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Sphingolipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Glycosphingolipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Glycosyl-N-acylsphingosines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents |
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| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physiological effect | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disposition | Biological location
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| Process | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Role | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
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| External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB023433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
