Showing chemical card for Iduronic acid (CFc000001682)
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| Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-09-13 18:46:22 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemfont ID | CFc000001682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecule Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Iduronic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Definition | Iduronic acid is a constituent of glycosaminoglycans heparin and heparan sulfate in varying proportions providing considerable diversity in sequence and biological function. The glycosaminoglycans (GAGs) are linear polysaccharides with alternating uronic acids (Iduronic acid and Glucuronic acid) and hexosamine residues, in which a limited set of monosaccharide units gives rise to a number of complex sequences by variable substitution with O-sulfate, N-sulfate, and N-acetyl groups. GAGs usually exist as the O-linked side-chains of proteoglycans, displaying a set of physiological functions which is remarkably wide and as yet incompletely explored. They may act as structural components of connective tissue and the extracellular matrix, or as specific ligands in the relationship between the cell surface and its surroundings. Heparan sulfate exists on the surface of most or all mammalian cells and can display a remarkable range of different sequence motifs; its range of interactions and possible functions reflect its structural complexity. The main repeat unit of heparin structurally resembles the protein binding sequences in heparan sulfate, but contains a higher percentage of sulfated residues. Utilized therapeutically as an anticoagulant and readily available in good quantities heparin serves as a useful model for heparan sulfate. Theoretical and experimental studies indicate that L-Iduronic acid residues of glycosaminoglycans are in equilibrium of different conformations, the relative proportion of conformers being a function of sulfation pattern and sequence. This unique conformational flexibility may provide an explanation for the stronger binding and associated higher biological activities of Iduronic acid-containing glycosaminoglycans (such as heparin, heparan sulfate and dermatan sulfate) as compared with other GAGs having similar charge density but with the more rigid glucuronic acid as the major uronic acid residue. Dermatan sulfates and heparins, which contain L-Iduronic acid in their backbone, show higher low-density lipoprotein (LDL)-affinity than chondroitin sulfates, which contain only D-glucuronic acid. Though confirming a non-specific, predominantly electrostatic interaction between GAGs and LDL, these results indicate modulation of LDL affinity by the polysaccharide backbone. Naturally oversulfated dermatan sulfate (SO3H/COOH ca. 1.2), mainly oversulfated at C-2 of Iduronic acid residues, show comparatively higher anticoagulant activity. (PMID: 3076283 , 8466951 , 8542607 , 11087707 ). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Chemical Formula | C6H10O7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 194.1394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 194.042652674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | (2S,3R,4R,5S)-2,3,4,5-tetrahydroxy-6-oxohexanoic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | iduronic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 3402-98-0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | O[C@H](C=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C(O)=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C6H10O7/c7-1-2(8)3(9)4(10)5(11)6(12)13/h1-5,8-11H,(H,12,13)/t2-,3+,4-,5+/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | IAJILQKETJEXLJ-LECHCGJUSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as glucuronic acid derivatives. Glucuronic acid derivatives are compounds containing a glucuronic acid moiety (or a derivative), which consists of a glucose moiety with the C6 carbon oxidized to a carboxylic acid. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic oxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Organooxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Glucuronic acid derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents |
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| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physiological effect | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disposition | Biological location
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| Process | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Role | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
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| External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0002704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB023047 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 17794 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | C06472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | 48353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Iduronic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | 3331 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 18845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 24769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Roden, Lennart; Dorfman, Albert. Metabolism of mucopolysaccharides in mammalian tissues. V. Origin of L-iduronic acid. Journal of Biological Chemistry (1958), 233 1030-3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
