Showing chemical card for Heparan sulfate (CFc000000545)
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| Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-09-13 18:44:57 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemfont ID | CFc000000545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecule Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Heparan sulfate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Definition | Heparan sulfate (HS) is a linear polysaccharide that belongs to the class of compounds known as glycosaminoglycans (PMID: 24146040 ). It is found in all animal tissues and consists of repeating subunits of N-acetylglucosamine and glucuronic acid, and closely related in structure to heparin. It occurs as a proteoglycan (HSPG) in which two or three HS chains are attached to either cell surface components or the extracellular matrix (ECM), where they serve to reinforce cell adhesion (PMID: 27241222 ). HS synthesis starts with the transfer of xylose from UDP-xylose by the enzyme known as xylosyltransferase (XT) to specific serine residues within the protein core. Attachment of two galactose (Gal) residues by galactosyltransferases I and II (GalTI and GalTII) and glucuronic acid (GlcA) by the enzyme glucuronosyltransferase I (GlcATI) completes the formation of a tetrasaccharide linker. After attachment of the first N-acetylglucosamine (GlcNAc) residue by the enzyme known as GalNAc Transferase I (GalNAcT-I), elongation of the tetrasaccharide linker is continued by the stepwise addition of GlcA and GlcNAc residues. These are transferred from their respective UDP-sugar nucleotides. HS functions through binding to a variety of protein ligands including interferon gamma, Wnt, antithrombin III, interleukin 8, fibroblast growth factor, endostatin and others. HS thereby regulates a wide range of developmental signaling pathways such as the Wnt, Hedgehog, transforming growth factor-β, and fibroblast growth factor pathways (PMID: 15563523 ). Heparan sulfate plays a role in a number of biological activities, including developmental processes, angiogenesis, blood coagulation, abolishing detachment activity by GrB (Granzyme B) and tumour metastasis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Chemical Formula | C14H23NO21S3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 637.522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 636.992468873 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | (2S,3R,4R,5S,6R)-4-hydroxy-3-methoxy-6-{[(2S,3R,4S,5S,6R)-6-methoxy-4-oxido-5-[(sulfooxy)amino]-2-[(sulfooxy)methyl]oxan-3-yl]oxy}-5-(sulfooxy)oxane-2-carboxylate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | tavidan | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 9050-30-0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | [H][C@@]1(O)[C@@]([H])(OC)[C@]([H])(O[C@@]([H])(O[C@@]2([H])[C@]([H])(COS(O)(=O)=O)O[C@@]([H])(OC)[C@@]([H])(NOS(O)(=O)=O)[C@]2([H])[O-])[C@@]1([H])OS(O)(=O)=O)C([O-])=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C14H24NO21S3/c1-29-9-7(17)10(35-38(23,24)25)14(34-11(9)12(18)19)33-8-4(3-31-37(20,21)22)32-13(30-2)5(6(8)16)15-36-39(26,27)28/h4-11,13-15,17H,3H2,1-2H3,(H,18,19)(H,20,21,22)(H,23,24,25)(H,26,27,28)/q-1/p-1/t4-,5-,6-,7+,8-,9+,10-,11-,13+,14+/m0/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | WKPUACLQLIIVJJ-RHKLHVFKSA-M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as disaccharide sulfates. These are disaccharides carrying one or more sulfate group on a sugar unit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic oxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Organooxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Disaccharide sulfates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents |
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| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physiological effect | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disposition | Biological location
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| Process | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Role | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
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| External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB022184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Heparan sulfate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 53477714 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Meier, Bernd Horst; Meier, Nele. Manufacture and use of modified adducts of polysaccharides and chitosan or chitin and a process to improve the preparation of polysaccharide-drug conjugates. PCT Int. Appl. (2007), 67pp. CODEN: PIXXD2 WO 2007122269 A1 20071101 CAN 147:487869 AN 2007:1237349 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
