Showing chemical card for Glutaconic acid (CFc000000481)
Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-09-13 18:44:52 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemfont ID | CFc000000481 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Glutaconic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Definition | Glutaconic acid is related to the fully saturated glutaric acid and belongs to the class of compounds known as dicarboxylic acids and derivatives. These are organic compounds containing exactly two carboxylic acid groups. Glutaconic acid is soluble (in water) and a weakly acidic compound (based on its pKa). Glutaconic acid has been detected in the urine of individuals with inborn errors of metabolism. When present in sufficiently high levels, glutaconic acid can act as an acidogen, a neurotoxin, and a metabotoxin. An acidogen is an acidic compound that induces acidosis, which has multiple adverse effects on many organ systems. A neurotoxin is a compound that is toxic to neural tissues and cells. A metabotoxin is an endogenously produced metabolite that causes adverse health effects at chronically high levels. Chronically high levels of glutaconic acid are associated with glutaric aciduria type I (glutaric acidemia type I, glutaryl-CoA dehydrogenase deficiency, GA1, or GAT1). GA1 is an inherited disorder in which the body is unable to completely break down the amino acids lysine, hydroxylysine, and tryptophan due to a deficiency of mitochondrial glutaryl-CoA dehydrogenase (EC 1.3.99.7, GCDH). Excessive levels of their intermediate breakdown products (e.g. glutaric acid, glutaryl-CoA, 3-hydroxyglutaric acid, glutaconic acid) can accumulate and cause damage to the brain (and also other organs), but particularly the basal ganglia. GA1 is associated with a risk for intracranial and retinal hemorrhage, and non-specific white matter changes. Babies with glutaric acidemia type I are often born with unusually large heads (macrocephaly). Other symptoms include spasticity (increased muscle tone/stiffness) and dystonia (involuntary muscle contractions resulting in abnormal movement or posture), but many affected individuals are asymptomatic. Seizures and coma (encephalopathy) are rare. GA1 also causes secondary carnitine deficiency because 3-hydroxyglutaric acid, like other organic acids, is detoxified by carnitine. Glutaconic acid's neurotoxicity is thought to be partially caused by an excitotoxic mechanism in which glutaconic acid overactivates N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptors. Accumulating trans-glutaconic (TG) acids have been proposed to be involved in the development of the striatal degeneration seen in children with glutaric acidemia type I via an excitotoxic mechanism. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C5H6O4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 130.0987 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 130.02660868 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2E)-pent-2-enedioic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | glutaconic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | 1724-02-3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | OC(=O)C\C=C\C(O)=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C5H6O4/c6-4(7)2-1-3-5(8)9/h1-2H,3H2,(H,6,7)(H,8,9)/b2-1+ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | XVOUMQNXTGKGMA-OWOJBTEDSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as dicarboxylic acids and derivatives. These are organic compounds containing exactly two carboxylic acid groups. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Carboxylic acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Dicarboxylic acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Dicarboxylic acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | Biological location
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Process | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | Biological role
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Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0000620 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | FDB022146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | C00052288 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 4444138 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C02214 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | GLUTACONATE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Glutaconic_acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | 5593 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 5280498 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 15670 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Schwarz, Siegfried; Bohn, Helmut; Schmidt, Dieter; Kulpa, Manfred; Spakowski, Horst; Becker, Manfred. Glutaconic acid. Ger. (East) (1967), 2 pp. |