Showing chemical card for 3-Methylglutaconic acid (CFc000000400)
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| Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-09-13 18:44:46 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemfont ID | CFc000000400 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecule Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | 3-Methylglutaconic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Definition | 3-Methylglutaconic acid is an intermediate (as the CoA thioester) in the leucine degradative pathway as well as the mevalonate shunt, a pathway that links isoprenoid metabolism with mitochondrial acetyl-CoA metabolism (PMID: 7603789 ). 3-methylglutaconyl-CoA hydratase is involved in the metabolism process of 3-methylglutaconic acid. When present in sufficiently high levels, 3-methylglutaconic acid can act as an acidogen and a metabotoxin. An acidogen is an acidic compound that induces acidosis, which has multiple adverse effects on many organ systems. A metabotoxin is an endogenously produced metabolite that causes adverse health effects at chronically high levels. Chronically high levels of 3-methylglutaconic acid are associated with at least five inborn errors of metabolism including 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase deficiency, 3-methylglutaconic aciduria type I, 3-methylglutaconic aciduria type III, 3-methylglutaconic aciduria type IV, and guanidinoacetate methyltransferase deficiency (GAMT deficiency). 3-Methylglutaconic acid is an organic acid. Abnormally high levels of organic acids in the blood (organic acidemia), urine (organic aciduria), the brain, and other tissues lead to general metabolic acidosis. Acidosis typically occurs when arterial pH falls below 7.35. In infants with acidosis, the initial symptoms include poor feeding, vomiting, loss of appetite, weak muscle tone (hypotonia), and lack of energy (lethargy). These can progress to heart, liver, and kidney abnormalities, seizures, coma, and possibly death. These are also the characteristic symptoms of the untreated IEMs mentioned above. Many affected children with organic acidemias experience intellectual disability or delayed development. In adults, acidosis or acidemia is characterized by headaches, confusion, feeling tired, tremors, sleepiness, and seizures. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Chemical Formula | C6H8O4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 144.1253 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 144.042258744 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | (2E)-3-methylpent-2-enedioic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | β-methylglutaconic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 5746-90-7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | C\C(CC(O)=O)=C/C(O)=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C6H8O4/c1-4(2-5(7)8)3-6(9)10/h2H,3H2,1H3,(H,7,8)(H,9,10)/b4-2+ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | WKRBKYFIJPGYQC-DUXPYHPUSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as methyl-branched fatty acids. These are fatty acids with an acyl chain that has a methyl branch. Usually, they are saturated and contain only one or more methyl group. However, branches other than methyl may be present. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Lipids and lipid-like molecules | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Fatty Acyls | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Fatty acids and conjugates | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Methyl-branched fatty acids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
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| Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physiological effect | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disposition | Biological location
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| Process | Naturally occurring process
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| Role | Biological role
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| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
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| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0000522 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB022090 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | C00052150 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 1267861 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | 3-Methylglutaconic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | 5507 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 1551553 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 37245 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Aoyama, Takayuki; Kato, Kazuo; Shimada, Nobuyoshi; Fujii, Akio; Takita, Tomohisa. Production of 3-methylglutaconic acid. Jpn. Kokai Tokkyo Koho (1986), 3 pp. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
