Showing chemical card for 3-Hydroxyglutaric acid (CFc000000326)
| Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-08-28 10:25:12 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-09-13 18:44:41 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemfont ID | CFc000000326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecule Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | 3-Hydroxyglutaric acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Definition | 3-Hydroxyglutaric acid is a member of the class of compounds known as dicarboxylic acids and derivatives. These are organic compounds containing exactly two carboxylic acid groups. 3-Hydroxyglutaric acid is soluble (in water) and a weakly acidic compound (based on its pKa). When present in sufficiently high levels, 3-hydroxyglutaric acid can act as an acidogen and a metabotoxin. An acidogen is an acidic compound that induces acidosis, which has multiple adverse effects on many organ systems. A metabotoxin is an endogenously produced metabolite that causes adverse health effects at chronically high levels. Chronically high levels of 3-hydroxyglutaric acid are associated with glutaric aciduria type I (glutaric acidemia type I, glutaryl-CoA dehydrogenase deficiency, GA1, or GAT1). GA1 is an inherited disorder in which the body is unable to completely break down the amino acids lysine, hydroxylysine, and tryptophan due to a deficiency of mitochondrial glutaryl-CoA dehydrogenase (EC 1.3.99.7, GCDH). Excessive levels of their intermediate breakdown products (e.g. glutaric acid, glutaryl-CoA, 3-hydroxyglutaric acid, glutaconic acid) can accumulate and cause damage to the brain (and also other organs), but particularly the basal ganglia. GA1 is associated with a risk for intracranial and retinal hemorrhage, and non-specific white matter changes. Babies with glutaric acidemia type I are often born with unusually large heads (macrocephaly). Other symptoms include spasticity (increased muscle tone/stiffness) and dystonia (involuntary muscle contractions resulting in abnormal movement or posture), but many affected individuals are asymptomatic. Seizures and coma (encephalopathy) are rare. GA1 also causes secondary carnitine deficiency because 3-hydroxyglutaric acid, like other organic acids, is detoxified by carnitine. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Formula | C5H8O5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 148.114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 148.037173366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | 3-hydroxypentanedioic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | 3-hydroxyglutaric acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 638-18-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | OC(CC(O)=O)CC(O)=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C5H8O5/c6-3(1-4(7)8)2-5(9)10/h3,6H,1-2H2,(H,7,8)(H,9,10) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | ZQHYXNSQOIDNTL-UHFFFAOYSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as beta hydroxy acids and derivatives. Beta hydroxy acids and derivatives are compounds containing a carboxylic acid substituted with a hydroxyl group on the C3 carbon atom. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Hydroxy acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Beta hydroxy acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Beta hydroxy acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physiological effect | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disposition | Biological location
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Role | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0000428 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | DB04594 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB022040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 158277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Alpha-Hydroxyglutaric acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | 5417 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 181976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 39980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Arnaud, Nathalie; Picard, Claude; Cazaux, Louis; Tisnes, Pierre. Synthesis of macrocyclic polyhydroxy tetralactams derived from L-tartaric acid and b-hydroxyglutaric acid. Tetrahedron (1997), 53(40), 13757-13768. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
